נהר פרוט נובע ממורדותיו המזרחיים של הר הוברלה בהרי הקרפטים, בתחום אוקראינה. בהמשכו מהווה הנהר את קו הגבול שבין רומניה ובין רפובליקת מולדובה ולבסוף נכנס לתוך רומניה גופא ונשפך לתוך הדנובה באזור העיר גאלאץ.אורכו של הנהר הוא 953 קילומטרים. יש אזורים לאורכו הניתנים למעבר כלי שיט.