La Universidad San Pedro se crea el 25 de junio de 1988, mediante ley N° 24871, como una institución sin fines de lucro, al amparo de la ley N°23733, consolidada por Decreto Legislativo N° 25969.
El 08 de marzo de 2001 en Consejo Universitario se aprueba crear la Filial de Cajamarca y el 18 de mayo de 2004 logra su reconocimiento y acreditacion como Filial ante la ANR de la mano del Rector, el Dr. Jorge Morales Chincha