A MOCISZ céljai:
- Azon civil szervezetek tömörítése, melyek fő feladatuknak tekintik a tagságuk egyéni céljainak megvalósulásán túl Mosonmagyaróvár, a mosonmagyaróvári kistérség és Nyugat-Dunántúl fejlődésének, az itt élő lakosság életkörülményei javításának elősegítését.
- A civil társadalom fejlődésének elősegítése, érdekképviselet biztosítása
- A helyi közélet, civil társadalom nyilvánosságának biztosítása
- Emberi és állampolgári jogok védelme
- Környezet- és természetvédelmi kultúra fejlesztése, szemléletformálás
- A hátrányos helyzetű rétegek munkaerőpiaci reintegrálása, képzése
- Kulturális értékek feltárása és ápolása, a lokálpatriotizmus erősítése
- Karitatív szerepvállalás a rászorultak támogatása érdekében, különös tekintettel a gyermek és ifjúsági korosztályra
- Közösségi színterek biztosítása, a civil szervezetek működési feltételeinek javítása
- A határokon átnyúló együttműködés révén hozzájárulni a határon túli magyarság kulturális életének fejlődéséhez, gazdításához.
- Az Európai Unió civil szervezetei együttműködésének és az euroatlanti integráció elősegítése
A MOCISZ tagja lehet minden mosonmagyaróvári és városkörnyéki jogi személyiséggel rendelkező civil szervezet. Egy-egy tagszervezet három küldöttje révén gyakorolja a létesítő okiratban szereplő jogait.