Tiền thân của trường Cao đẳng Kinh tế-Kỹ thuật Kon Tum là Trường Tài Chính tỉnh Gia Lai –Kon Tum, được thành lập năm 1976.
Từ năm 1976 -1986 : Trường Tài chính tỉnh Gia Lai Kon Tum.
Năm 1984 Sau khi sát nhập với Trường Thống Kê – Kế hoạch, trường được đổi tên thành trường Nghiệp vụ Kinh tế tỉnh Gia Lai Kon Tum ( Trực thuộc Sở Tài Chính Gia lai Kon Tum.
Năm 1986 nâng cấp lên thành Trường Trung Học Kinh tế tỉnh Gia lai Kon Tum.
Năm 1992 sát nhập với các trường Trung Học Nông nghiệp và Trường Công nhân Lái xe thành Trường Trung Học Kinh tế Kỹ Thuật Tổng hợp Tỉnh Kon Tum
Đến tháng 3 năm 2006 Bộ trưởng Bộ Giáo dục & Đào tạo ra Quyết định số 1100/QĐ-BGD&ĐT ngày 08/3/2006 thành lập trường Cao đẳng Kinh tế-Kỹ thuật Kon Tum trên cơ sở nâng cấp trường TH.Kinh tế-Kỹ thuật TH Kon Tum.