663 Sayılı Sağlık Bakanlığı ve Bağlı Kuruluşlarının Teşkilat ve Görevleri Hakkında Kanun Hükmünde Kararname 02 Kasım 2011 tarihinde yayımlanarak yürürlüğe girmiştir. Bu kapsamda Sağlık Bakanlığı Merkez ve Taşra Teşkilatı ile Bağlı Kuruluşları yeniden yapılandırılmıştır.
Bu yapılandırma gereği 20 Mart 2012’ de Müdürlüğümüz İl Sağlık Müdürlüğünün bünyesinden ayrılmıştır. Yozgat Halk Sağlığı Müdürlüğü İl Sağlık Müdürlüğü ile aynı binayı kullanmaktadır. Zemin kat ve 2. Katta Şube Müdürlüklerimiz hizmet vermektedir. Aynı zamanda Halk Sağlığı Laboratuvarının ikinci katı Ek Bina olarak kullanılmakta olup, Bulaşıcı Olmayan Hastalıklar, Programlar ve Kanser Şube Müdürlüğümüz hizmet vermektedir.