ทางรถไฟสายสุพรรณบุรี ถือเป็นส่วนหนึ่งของโครงการทางรถไฟสายตะวันตก ชุมทางหนองปลาดุก - ชุมทางตาก (บรรจบกับโครงการ สายบ้านดารา - สวรรคโลก - ตาก - เมาะละแหม่ง) และแนวเส้นทาง สุพรรณบุรี - ชุมทางบ้านภาชี ซึ่งได้ระงับการก่อสร้างลงไปเมื่อก่อสร้างมาถึงที่หยุดรถไฟมาลัยแมน ปัจจุบันทางรถไฟสายนี้ได้ยุบสถานีรายทางเหลือเพียงสถานีเดียวคือ สถานีสุพรรณบุรี ที่เหลือมีฐานะเป็นเพียงที่หยุดรถ และป้ายหยุดรถตารางเวลาเดินรถ*กำหนดเวลาเดินรถ ใช้ตั้งแต่วันที่ 20 เมษายน 2552