جامع مسجد کرنال والی سے ملحق ایک مدرسہ الفرقانیہ بھی ہے۔جس میں کثیرتعداد میں مختلف جگہ سے آئے طلباءمختلف علوم حاصل کرتے ہیں۔اس کے ساتھ ساتھ خواتین کے لیے جامعہ فاطم الزھرہ (ر۔ض)موجود ہے۔جس میں کثیر تعداد میں مسافر طالبات عالمہ،حفظ،ناظرہ،ترجمہ اور تفسیرِالقران کی تعلیم حاصل کرتی ہیں۔دونوں مدارس ۪(وفاق المدارس العربیہ پاکستان)سے رجسٹرڈ ہیں۔اور ہر سال طلباءو طالبات پوزیشنز حاصل کرتے ہیں۔