Az MRI a következő szervek / testrészek kiértékelésére alkalmas:
- idegrendszer
- csontok, izületek
- szív, erek (MR angiográfia)
- hasi szervek (máj, hasnyálmirigy, epeutak, lép, vesék)
- kismedencei szervek: férfi (prosztata, herék) és női nemi szervek (petefészek, méh, méhnyak)