Ο Βυζαντινός αυτοκράτορας Αλέξιος ο Κομνηνός εγκατέστησε στην Κρήτη δώδεκα οικογένειες Βυζαντινών αρχόντων οι οποίες στήριξαν την αντίσταση κατά των Βενετών. Ανάμεσα σε αυτές τις οικογένειες αναφέρεται και η οικογένεια του Αρκολέων μια από τις σημαντικότερες πολιτικά και οικονομικά στο νησί. Την περιοχή του Αρκαλοχωρίου κατείχε ένα από τα δώδεκα αρχοντόπουλα της οικογένειας και η άποψη είναι ότι το όνομα του χωριού προέρχεται από το όνομα της ομώνυμης οικογένειας. Σε έγγραφο του 1394 αναφέρεται το χωριό ως "Αρκολεχώριον" και ταυτίζεται με το όνομα "Αρκολέων". Εμείς αυτό κρατήσαμε και δώσαμε το όνομα αυτό στο χώρο μας!!