Το Μουσικό Σχολείο Κομοτηνής λειτουργεί απο το 1993 και είναι από τα παλαιότερα Μουσικά Σχολεία που λειτουργούν σήμερα σε όλη την Ελλάδα.
Στο Μουσικό Γυμνάσιο-Λύκειο Κομοτηνης, τα μαθήματα γενικής παιδείας διδάσκονται, όπως και σε όλα τα Δημόσια Γυμνάσια και Λύκεια της χώρας. Επιπλέον, διδάσκονται ισότιμα η έντεχνη δυτική και ελλήνική παραδοσιακή μουσική, με στόχο να αποκτήσουν όλοι οι μαθητές του σχολείου μια αξιόπιστη γενική μουσική παιδεία και απαραίτητα εφόδια για ενδεχόμενες ανώτερες μουσικές σπουδές.
Πολλοί μαθητές μας συνεχίζουν τις σπουδές τους σε διάφορες Ανώτατες Σχολές (Ιατρική, Φιλοσοφική, Νομική, Πολυτεχνείο, Παιδαγωγικά Τμήματα, κ.λ.π.) και στα Πανεπιστημιακά Τμήματα Μουσικών Σπουδών, ενώ άλλοι ακολουθούν ανώτερες μουσικές σπουδές στο εξωτερικό.
Στο πρόγραμμα σπουδών του σχολείου περιλαμβάνονται και μαθήματα ευρύτερης αισθητικής παιδείας όπως είναι τα εικαστικά και το θέατρο.