Το Μουσικό Σχολείο Σπάρτης ιδρύθηκε με την υπ` αριθμ. Δ4/354 25/08/2001 υπουργική απόφαση ως Μουσικό Γυμνάσιο Σπάρτης.
Σκοπός των Μουσικών Σχολείων με βάση τον ιδρυτικό τους νόμο 3345/2.9.1988 άρθρο 1, είναι:
"Η προετοιμασία και η κατάρτιση των νέων που επιθυμούν να ακολουθήσουν την επαγγελματική κατεύθυνση της μουσικής χωρίς να υστερούν σε γενική παιδεία, αν τελικά επιλέξουν άλλο τομέα επιστημονικής ή επαγγελματικής έκφρασης."
Στο Μουσικό Σχολείο Σπάρτης διδάσκεται το σύνολο των μαθημάτων της Δευτεροβάθμιας Εκπαίδευσης, όσα δηλαδή περιλαμβάνονται στο Πρόγραμμα Σπουδών όλων των Γυμνασίων και Λυκείων της χώρας, καθώς και η έντεχνη δυτική και η ελληνική παραδοσιακή μουσική ισότιμα. Στόχος της διδασκαλίας των μουσικών μαθημάτων είναι να εφοδιαστεί το σύνολο των μαθητών του σχολείου με βασικές μουσικές γνώσεις και δεξιότητες με αξιόπιστο τρόπο, αλλά και να προετοιμάσει όσους μαθητές ενδιαφέρονται να παρακολουθήσουν ανώτερες μουσικές σπουδές. Στο πλαίσιο της ευρύτερης καλλιτεχνικής μόρφωσης των μαθητών διδάσκονται μαθήματα αισθητικής παιδείας, όπως Θεατρική Αγωγή, Καλλιτεχνικά και Ιστορία της Τέχνης.
Με απόφαση του Δημοτικού Συμβουλίου Σπάρτης παραχωρήθηκαν το 2004 έξι (6) στρέμματα οικοπέδου στην περιοχή Κλαδά, όπου και αυτό το διάστημα πραγματοποιείται η μεταστέγαση στο ολοκαίνουργιο κτήριο.
Διευθυντής το πρώτο έτος λειτουργίας του σχολείου διετέλεσε ο κ. Κωνσταντίνος Τσαγκαρούλης (ΠΕ 16, Μουσικός), από το 2002 έως το 2015 η κα. Αγγελική Αργειτάκου (ΠΕ 02, Φιλόλογος), ενώ από το 2015 έως σήμερα διατελεί διευθυντής ο κ. Διαμαντής Μανεσιώτης (ΠΕ 03, Μαθηματικός).