GéoArchÉon propose des collaborations scientifiques en géoarchéologie et pour l'étude des paléoenvironnements pour les différentes structures intervenant dans le cadre des recherches archéologiques (préventives ou programmées). GéoArchÉon a également la volonté de promouvoir l’ensemble des disciplines naturalistes appliquées à l’archéologie et à l’étude des paléoenvironnements. La diffusion et la médiation scientifique auprès du public des résultats de la géoarchéologie et des études paléoenvironnementales font également partie des missions de GéoArchÉon.