Kranio-Sakral terapi arbejder med bindevæv, muskler, organer, knogler, membraner (hjernehinder), cerebrospinalvæske (hjernevæske) og har hermed indflydelse på nerve-, hormon- og immunsystemet og har dermed en effekt på hele kroppen.
Noget af filosofien bag behandlingen er at ved at hjælpe og støtte kroppen kan den selv finde tilbage til sit naturlige leje. Det sker ved at lytte til klientens krop og møde den på en respektfuld måde.
Under en behandling kan der opstå fornemmelse af varme i kroppen, afslappethed, lettelse, træthed eller det giver energi. Det kan også være en følelsesmæssig reaktion. Det er meget forskelligt hvad der sker. Reaktionerne efter en behandling er ligeledes meget forskellige.