Det Nationale Fotomuseum arrangerer skiftende udstillinger med udgangspunkt i museets store samling og gennem internationale samarbejder. I 2014 og 2015 viser museet bl.a. udstillinger om krigsfotografi fra 1864, med den østrigsk-amerikanske kunstnerduo Cooper & Gorfer og med den danske fotograf Joakim Eskildsen.
Det Nationale Fotomuseum har en af Europas fineste samlinger af fotografisk kunst fra 1839 til i dag. Samlingen opbevares på magasin, men den er tilgængelig for forskere og andre interesserede, hvis de bestiller tid først. En stor del af samlingen er registreret i Kunstindeks Danmark, så du kan søge i den her: www.kid.dk