El programa de maestría en Agroforesteria Tropical de la Universidad de Nariño, busca la formación de profesionales con alto nivel académico-científico, que genere procesos de investigación, tecnología e innovación en Agroforestería y conduzcan al buen uso de los recursos naturales en sus diferentes campos y que en el corto, mediano y largo plazo afronten decididamente la problemática ambiental y productiva en el ámbito regional y nacional.
Así mismo, busca la conformación de equipos de trabajo multidisciplinarios e interdisciplinarios para desarrollar investigación en diferentes campos del saber, que identifiquen problemas ambientales y propongan alternativas de solución eficaces con un enfoque sistémico que conduzcan al mejoramiento de la calidad de vida del ser humano, en ese contexto, el Programa, se articula a procesos de globalización a través de la conformación de una comunidad científica orientada a una opción de desarrollo sustentable.