El origen de la facultad de Ciencias y Educación se remonta a la creación del Departamento de Ciencias Fundamentales en el año 1972. La universidad amplía su cobertura en el año 1973 y comienza a funcionar las carreras de Licenciatura en Física, Licenciatura en Química, Licenciatura en Biología y Licenciatura en Matemáticas. Para el año de 1974 se crearon las Licenciaturas en Idiomas y Ciencias Sociales y en 1981 inicia la Licenciatura en Básica Primaria. En 1980, después de un prolongado cierre, la universidad amplía su planta física con la construcción de la Macarena A, con ello se introducen reformas de organización académica de los programas en torno a los campos de conocimiento. En 1980 se crea la Facultad de Ciencias y Educación la cual actualmente cuenta con 10 proyectos curriculares de pregrado, 13 proyectos curriculares de postgrado: 6 especializaciones, 6 maestrías, y un doctorado interinstitucional en Educación.
Como Resultado de los procesos de autoevaluación y autorregulación la Facultad tiene ocho (8) proyectos curriculares Acreditados de Alta Calidad por el Ministerio de Educación.