Sus principales objetivos de gestión son:
* Contribuir a la formulación de la política de riego nacional.
* Mejorar la eficiencia del riego a través de proyectos de desarrollo y transformación productiva.
*Focalizar los esfuerzos hacia el desarrollo de regiones extremas del país y grupos de productores en situación vulnerable.
*Fomentar la inversión privada en obras de riego mediante la optimización de inversiones y asignación de subsidios en riego y drenaje.
*Evaluar la factibilidad técnica y económica de inversiones en obras rentables de riego de las cuencas hidrográficas del país.