Especializado em neurocirurgia, o Hospital São José é centro de referência dessa especialidade há 50 anos. Realiza todos os procedimentos neurocirúrgicos, inclusive os de alta complexidade como cirurgias vasculares, hipofisárias, de todos os tipos de tumores que afetam o sistema nervoso, de todas as patologias raquianas e de outras doenças neurocirúrgicas.
Abriga a Neurofisiologia Clínica, composta pelos serviços de Eletroencefalografia e Eletroneuromiografia.
O Serviço de Neurorradiologia, pioneiro no Rio Grande do Sul, realiza todos os exames concernentes à área de diagnóstico por imagem e todos os estudos de Neurorradiologia Intervencionista.
A equipe intensivista, de alta qualidade técnica e humana, reúne uma das maiores experiências do país em pós-operatório na área da neurocirurgia.