O Centro de Controle de Zoonoses de Ubatuba está vinculado ao Departamento Técnico de Vigilância Ambiental, da Supervisão de Vigilância em Saúde, da Secretaria Municipal de Saúde. Além das ações e serviços voltados para as zoonoses e acidentes com animais destacados na definição acima, o CCZ também faz orientações de animais sinantrópicos, de algumas doenças parasitárias (como o Bicho-de-pé e Bicho Geográfico) e realiza vistorias zoosanitárias e atendimento de denúncias de maus tratos a animais por seus proprietários.