La Sociedad San Juan lleva adelante su misión evangelizadora a través de la “Asociación San Juan Apóstol” (ASJA), que a través de programas específicos se adapta a las características de edad, situación cultural, e inquietudes de aquellos a quienes se dirige la acción misionera.
La Asociación San Juan Apóstol y la Sociedad San Juan están íntimamente unidas por su mismo origen y por compartir un mismo espíritu. De ahí el nombre de ambas, ya que asumen como texto fundacional el Evangelio según San Juan.
Se divide en dos ramas:
Rama ‘San Juan’: integrada por estudiantes secundarios y universitarios, y los profesionales. Su fin es procurar con todo empeño que este sector de la sociedad, se adhiera a Cristo y a su mensaje y así trasforme la realidad según los valores del reino y realicen en ese ámbito un fecundo apostolado.
Rama ‘San José’: integrada por los más abandonados, para que la Buena Noticia sea anunciada a los pobres. Su fin es suscitar entre ellos líderes capaces de animar sus comunidades y de ser levadura en su ambiente.
La tarea de nueva evangelización de la ASJA se dirige a estos dos ámbitos específicos, tratando de hacer un verdadero ministerio de la unidad en Cristo.